Sequencher DNA序列分析軟件是科學(xué)家們必備的工具。持續(xù)發(fā)展和改進(jìn)超過25年，Sequencher提供了無(wú)與倫比的功能特征，成千上萬(wàn)的出版物都有相關(guān)的應(yīng)用介紹。新手用戶可以以最少的時(shí)間投資產(chǎn)生結(jié)果，而有經(jīng)驗(yàn)的用戶會(huì)驚嘆于功能的深度和控制。Sequencher自帶各種專有算法，可以為Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列數(shù)據(jù)生成結(jié)果。

Sequencher 5.4.6新功能

為DNA序列分析提供了全新的和增強(qiáng)的功能。

Sanger

• Sequencher Connections中運(yùn)行的 Primer-BLAST發(fā)送引物序列到您的Sequencher項(xiàng)目中。

• 在項(xiàng)目窗口中輕松使用一致性序列，作為NGS測(cè)序比對(duì)混合的參考序列。

• 新批量處理恢復(fù)結(jié)束命令。

• 在項(xiàng)目窗口中調(diào)整字體大小的功能。

NGS

• GSNAP和BWA-MEM工作流更快。

• 構(gòu)建GSNAP數(shù)據(jù)庫(kù)和BWA索引，這些索引可以被重新用于與整個(gè)基因組的對(duì)齊。

• 查看并保存用FastQC報(bào)告的NGS原始數(shù)據(jù)文件的質(zhì)量分?jǐn)?shù)和元數(shù)據(jù)。

• 使用SAMtools在您的NGS校準(zhǔn)中標(biāo)記變量來(lái)生成不同的調(diào)用文件(VCF)。

RNA-Seq

•  隨著Cuffquant和Cuffnorm的添加，擴(kuò)展了Cufflinks套件的功能。

• Cuffdiff和 Cuffnorm的Conditions and Replicates編輯器。

• 使用自定義排序和篩選選項(xiàng)來(lái)增強(qiáng)RNA-Seq可視化功能。

• 使用增強(qiáng)的外部數(shù)據(jù)瀏覽器輕松管理所有的DNA-Seq和RNA-Seq項(xiàng)目。

Sanger序列

Sequencher使傳統(tǒng)的序列裝配變得容易，同時(shí)又能讓您保持對(duì)序列的控制。精簡(jiǎn)數(shù)據(jù)質(zhì)量差的序列。您甚至可以創(chuàng)建一個(gè)整潔的標(biāo)準(zhǔn)庫(kù)，讓一切變得更簡(jiǎn)單。通過直觀的控制，您可以為數(shù)據(jù)選擇算法，包括匯編到參考中。如果您正在處理來(lái)自不同來(lái)源的多個(gè)示例，可以通過名稱來(lái)對(duì)它們進(jìn)行自動(dòng)裝配。使用工具編輯數(shù)據(jù)從來(lái)沒有如此簡(jiǎn)單過，幫助您定位和處理模棱兩可的問題，還可以檢查雜合子并移動(dòng)您的數(shù)據(jù)。使用信任值幫助修整數(shù)據(jù)、質(zhì)量檢查和SNP檢測(cè)，以提高數(shù)據(jù)結(jié)果的質(zhì)量。